單位定義
74℃,30min,使10 nm dNTP摻入酸不溶性沉淀物所需要的酶量定義為1個活力單位。
活性檢測條件:50 mM Tris-Hcl(pH 9.0, 25℃),50 mM NaCl, 5 mM MgCl2,0.2 mM each dNTPs(包括[3H]-Dttp), 200 μg/ml 活化的小牛胸腺DNA和0.1 mg/ml BSA。
質量控制
SDS-PAGE 檢測純度大于99%。經檢測無外源核酸酶活性,PCR方法檢測無宿主DNA殘留,能有效擴增人類基因組中的單拷貝基因。
PCR體系成分
1. 模板DNA的純度:很多殘留的核酸提取試劑會影響PCR反應,包括蛋白酶、蛋白變性劑(比如SDS、胍鹽)、高濃度鹽(KAc、NaAc、辛酸鈉等)和高濃度EDTA等。純度不高的模板(比如煮沸法獲取的模板)用量請勿超過PCR反應體系的1/10(比如50 μl反應體系中加入模板的體積不應超過5μl)。如果模板DNA純度太差,可使用新景(Simgen)PCR清潔試劑盒(Cat. No.2101050)對模板DNA進行純化及濃縮。經新景(Simgen)PCR清潔試劑盒純化后的模板使用量可多至PCR反應體系體積的1/2。
2.模板DNA用量:極微量的DNA也可以作為PCR摸板,但為保證反應的穩定性,50μl體系建議使用104拷貝以上的靶序列作為模板。模板 DNA 的推薦使用量:
人基因組 DNA:0.05 μg~0.5 μg/50 μl PCR反應體系
大腸桿菌基因組 DNA:10 ng~100 ng/50 μl PCR反應體系
λ DNA:0.5 ng~5 ng/50 μl PCR反應體系
質粒DNA:0.1ng ~ 10 ng/50 μl PCR反應體系
如需用擴增產物作為模板再擴增,應至少將擴增產物稀釋1,000至10,000倍后再作為模板使用,否則可能會出現涂抹條帶或無特異性條帶。
3. 引物濃度:一般每條引物配制的濃度為10 μM (50×),工作濃度為0.2 μM。引物過量可能會出現非特異性擴增,引物過少則可能會降低擴增效率。