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酵母DNA提取方法

作者:新景實驗室
版權說明:本文系原創文章 轉載請標注出處和本文鏈接

方法一:

石英砂法
15000rpm×5min 收集過夜培養的菌體(5ml左右),于 200μL 裂解液(50 mmol/ L Tris-HCl pH 8.0 , 180 mmol/ LEDTA pH 8.0 , 1 % SDS , 現配)中,加入 3/10 總體積石英砂在渦流混合器上振蕩 13min,每隔 4min 將離心管取出用力甩幾下,然后 65水浴 10min
2
、加入 200μL 5mol/L KAc,冰浴 8min;
3
12000rpm×5min 轉移上清至新的離心管中;
4
、加入 3 mol/L NaAc 35μl,加入異丙醇 200μL混勻后冰浴 8min12000rpm×5min收集沉淀;
5
、200μL TE 溶解,加入 RNase10μL65水浴 10min
6
、加入 200μL 氯仿-異戊醇(24:1,抽提;
7
、溫柔地取上清 150μL ,加入 20μL 3 mol/L NaAc 375μL 無水乙醇,混勻后12000rpm×8min 收集 DNA;
8
70% 乙醇洗滌沉淀,吹干后 TE 溶解,-20保藏。

方法二:

蝸牛酶法
1. 接種于5 mlYEPD培養基中在25-28振蕩培養12-16 h。
2. 3500 rpm
離心5min沉淀細胞,用1ml 的無菌水洗滌一次,再加0.5ml solution (1M 山梨醇,0.1M EDTA, pH=7.5)重懸。
3.
轉移細胞至1.5 ml 的離心管中,加入0.1蝸牛酶 (30mg/ml)溶液,37保溫30-60min, 以獲得原生質體。
4.
最大轉速離心1min以沉淀細胞,用500ulsolution(50mMTris-HCl, 20mM EDTA,pH=7.4)溶液懸浮,然后加入50μl 10% SDS, 混合65保溫30min。
5.
加入200μl 5M 醋酸鉀,放于冰上30 min
6.
最大轉速離心15min,轉移上清液至新的離心管中,用等體積的異丙醇沉淀DNA。
7.
室溫下放置5min,離心10min,用70%的乙醇洗滌一次,真空干燥,用50ul pH=7.4 TE溶液溶解。

 

方法三:

蝸牛酶過夜處理法

將酵母接種到YPD培養基中30過夜培養1618h,離心收集1.5mL,用滅菌水洗滌兩次;加入600μL裂解液,35μL蝸牛酶,37消化過夜;加入飽和酚450μL,氯仿-異戊醇(體積比24:1)150μL,輕輕顛倒混勻使溶液成為乳狀,并保持10min3000r/min離心10min;吸取上清液,用氯仿-異戊醇(體積比24:1)450μL再抽提1次,10000r/min離心5min;取上清加入異丙醇800μL,-20靜置30min10000r/min離心5min,沉淀物用70%乙醇洗兩次,自然干燥后溶于30μL TE緩沖液;加入0.5μL10mg/mLRNaseA37溫浴30min,自然冷卻后保存。

 

方法四:

蝸牛酶反復凍融法

收集過夜培養1618h的菌體1.5mL,加入500μLPBS溶液重懸菌體,12000r/min離心2min,用PBS重洗一次;將沉淀溶于35μL的蝸牛酶溶液中,加入65μLPBS,45作用2h,加100μL裂解液,-20冷凍,然后室溫振蕩溶解,反復3次;向懸浮液中加入150μL 5mol/L KAc(pH8.9)輕輕混勻,然后10000r/min離心5min;取上清液,加入兩倍體積的無水乙醇,輕輕混勻,室溫放置5min;12000r/min離心10min,將沉淀溶解在100μL TE中;加入等體積的酚-氯仿-異戊醇(體積比25:24:1),輕柔顛倒混勻,12000r/min離心5min,重復抽提1次;加1/10體積的3mol/L醋酸鈉(pH5.2),2.5倍體積的無水乙醇,-20放置30min;10000r/min離心5min,棄上清液,用70%乙醇溶液洗滌沉淀兩次,室溫干燥后用20μL TE溶解;加入0.5μL 10mg/mLRNaseA,37溫浴30min,自然冷卻后保存。

 

方法五:

溶解在100μL TE中;加入等體積的酚-氯仿-異戊醇(體積比25:24:1),輕柔顛倒混勻,12000r/min離心5min,重復抽提1次;加1/10體積的3mol/L醋酸鈉(pH5.2),2.5倍體積的無水乙醇,-20放置30min;10000r/min離心5min,棄上清液,用70%乙醇溶液洗滌沉淀兩次,室溫干燥后用20μL TE溶解;加入0.5μL 10mg/mLRNaseA,37溫浴30min,自然冷卻后保存。

 

方法六:

1、配一個破菌緩沖液:
Triton X-100        2
%(v/v        SDS       1%w/v
NaCl        100mM       Tris-HCl
pH 8.0       10mM
2
、把酵母細胞離心收集,加200ul的石英砂或玻璃珠,加入200μl的破菌液再加200μl的酚氯仿,渦旋一分鐘,放在冰上一分鐘,一共反復4
3
、加入500μlddH2O,渦旋,離心,抽上清和等體積的酚氯仿混合
4
、渦旋,離心,抽上清和等體積的酚氯仿混合,重復4直到離心后兩層之間沒有蛋白出現
5
、抽上清加1ml的無水乙醇,放在-2030min
6
、離心,抽上清,再用70%乙醇洗一次,真空干燥,用TEddH20溶解

 

方法七:

接種酵母到2.5ml 酵母試管培養基中(YPD培養基), 30,培養1618h;取1.5ml 酵母培養液,室溫下, 1500 × g 離心510min 收集菌體;菌體用滅菌水洗1 次, 1500 ×g離心5min;菌體用200μl SCED(1mol/L 山梨醇、 10mmol/L 檸檬酸鈉、10mmol/LEDTA、10mmol/L DTT 二硫蘇糖醇)溶液重懸,加入3 0μl 10mg/ml 溶菌酶(Lysozyme)37溫浴1h;加入100μl 2%SDS 混勻,-20冰凍,然后室溫震蕩溶解,反復3 次;向懸浮液中加150μl 5mol/L KAc(pH 8.9)輕輕混勻,然后10000r/min 離心5min;將上清轉移到一新的1.5ml 離心管中,加入 2 倍體積的乙醇,輕輕混勻,室溫放置5min 12000r/min 離心10min;除去上清,將沉淀溶解在300μl TE(10mmol/L Tris-HClpH7.4,1mmol/L EDTA,pH8.0) 中,加入 6μl RNase (10mg/ml)37溫浴30min;加入飽和酚和氯仿各150μl 充分混勻,然后10000r/min離心5min;轉移上清到新的1.5ml 離心管中,加入1/2體積的7.5mol/L NH4Ac(pH7.5)和等體積的異丙醇,-20放置20min 12000r/min 離心10min;除去上清,加入300μl 70% 乙醇漂洗沉淀一次,10000r/min離心5min;風干除去乙醇,用2 0μl TE 溶解酵母DNA


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