蘄蛇是蝰科動物五步蛇的干燥體,具有祛風(fēng)、通絡(luò)、止痙的功效。近年來,由于資源有限,價格昂貴,出現(xiàn)了用其他蛇冒充蘄蛇或在蘄蛇體內(nèi)摻假的現(xiàn)象,因此近些年的《中國藥典》中蘄蛇鑒定方法改為聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)法(PCR法)。前段時間江西百仁中藥找到了我們,想讓我們設(shè)計一套方案來鑒定蘄蛇的真?zhèn)危⒓膩砹艘恍┨I蛇測試樣本。現(xiàn)在我們把鑒定真?zhèn)翁I蛇的方法分享給大家。
一、實驗?zāi)康?/span>
提取蘄蛇樣本中的DNA,用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)法(PCR法)對蘄蛇進(jìn)行真?zhèn)舞b定。
二、實驗材料:
1. 蘄蛇待檢樣品(曬干的蛇肉)和陽性對照品(粉末狀)
2. 動物組織DNA試劑盒(Simgen Cat.No.3101050)
3. 2×Taq plus PCR Master Mix(Simgen Cat.No.7005100)
4. 蘄蛇特異性引物(F:5’-GGCAATTCACTACACAGCCAACATCAACT-3’ /R:5’-CCATAGTCAGGTGGTTAGTGATAC-3’)
5. 超微量電子天平(DENVER INSTRUMENT,TP-213)
6. 電子恒溫不銹鋼水浴鍋(上海宜昌儀器紗篩廠)
7. 旋渦震蕩器(越新儀器,XH-C)
8. 臺式離心機(jī)(eppendorf Centrifuge 5415 D)
9. 超微量分光光度計(SIMGEN Cat.No.sim100)
10. 電泳儀(北京六一儀器廠,DYY-6C型 )
11. PCR儀(Techne FPROGO5Y Progene Thermal)
三、實驗內(nèi)容:
本次實驗使用Simgen動物組織DNA試劑盒提取蘄蛇樣本DNA,再用Simgen 2×Taq plus PCR Master Mix擴(kuò)增提取的DNA,具體步驟如下:
1. 用手術(shù)刀從待檢樣本上刮下一些組織粉末,稱取25 mg,轉(zhuǎn)移至1.5 mL離心管中。
2. 加入20 μl蛋白酶K貯存液,再加入180 μl的Buffer AT。
3. 56℃水浴3小時(因為樣本已經(jīng)曬制成干,較難溶解),期間旋渦震蕩數(shù)次幫助組織溶解。
4. 加入200 μl Buffer SL,旋渦震蕩約15秒混勻。將離心管置于70℃水浴10分鐘。
5. 12000 rpm離心1分鐘,吸取上清液轉(zhuǎn)移到另一個1.5 ml離心管中,加入200 μl無水乙醇,旋渦震蕩約15秒混合均勻。
6. 將溶液加入到核酸純化柱中,12000 rpm離心30秒棄濾液。
7. 加入500 μl Buffer WA,12000 rpm離心30秒棄濾液。
8. 加入600 μl Buffer WB,12000 rpm離心30秒棄濾液。
9. 14000 rpm離心1分鐘去除殘留液體。
10. 將核酸純化柱置于一個潔凈的1.5 ml離心管中,加入100 μl Buffer TE,室溫靜置1分鐘。
11. 12000 rpm離心30秒洗脫得DNA。
12. 在超微量分光光度計上測量提取到的DNA的濃度。
13. 用2×Taq Plus PCR Master Mix擴(kuò)增蘄蛇特異性引物,配置體系如下表:
14. PCR反應(yīng)參數(shù)設(shè)置為;95℃預(yù)變性5 min,循環(huán)反應(yīng)35次(95℃ 30s,63℃ 45s),延伸(72℃)5分鐘。
15. 對提取到的DNA和PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳。
四、實驗結(jié)果:
1. 在超微量分光光度計上用試劑盒中的Buffer TE調(diào)零,測量提取好的DNA,結(jié)果如下:
樣品編號1、2為陽性對照樣品提取的DNA;
樣品編號3、4為待檢蛇肉樣品提取的DNA。
2. 在3%的瓊脂糖凝膠上,加入5 μl提取到的DNA和擴(kuò)增產(chǎn)物,電泳30 min,結(jié)果如下:
五、實驗討論與分析
1. 從超微量分光光度計濃度測量結(jié)果上分析,不管是陽性對照還是待檢蛇肉樣本提取到的DNA濃度都不高,只有一管待檢蛇肉樣本(3號樣本)提取的DNA濃度稍高一些。推測可能是蘄蛇在風(fēng)干或制成粉末的過程中降解了DNA,導(dǎo)致最后提取到的DNA量較少。
2. 從電泳圖分析,陽性對照和待檢蛇肉樣本提取的DNA都看不到明顯的條帶,只有一管待檢蛇肉樣本(3號樣本)提取的DNA能隱約看到較暗淡的基因組DNA條帶,與測得的DNA濃度結(jié)果有對應(yīng)關(guān)系。
3. 雖然提取到的DNA濃度低,但并不影響PCR擴(kuò)增,陽性對照和待檢蛇肉樣本提取的DNA均成功擴(kuò)增出了條帶,且兩者位置一致,證明待檢蛇肉樣本確實是蘄蛇。
4. 本次PCR擴(kuò)增中,由于DNA濃度低,相應(yīng)的增加了模板DNA的用量,達(dá)到了15 μl。如此高的模板用量,PCR擴(kuò)增卻沒有受到影響,說明了動物組織DNA試劑盒提取的DNA潔凈度高,抑制物少。
·經(jīng)典蛋白酶K消化步驟,適合從各種不同來源的動物組織(包括鼠尾、鼠耳、福爾馬林固定組織等)中分離純化DNA·可從體液樣本(包括抗凝全血、唾液、培養(yǎng)細(xì)胞懸液等)分離純化DNA·可從昆蟲、革蘭氏陰性菌或革蘭氏陽性菌中分離純化DNA· 無須酚氯仿抽提及異丙醇沉淀步驟 查看產(chǎn)品
·產(chǎn)品中添加的Taq酶抗體、PCR增強劑和蛋白穩(wěn)定劑協(xié)同提高了PCR效率和靈敏度·Taq和Pfu酶協(xié)同作用,既兼顧了擴(kuò)增產(chǎn)物的高保真性,又保證了擴(kuò)增片段的長度,可以從基因組DNA中擴(kuò)增出長達(dá)4kb的片段或者從λDNA中擴(kuò)增出長達(dá)5kb的片段 查看產(chǎn)品