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血凝塊DNA提取方法

作者:新景實驗室
版權(quán)說明:本文系原創(chuàng)文章 轉(zhuǎn)載請標注出處和本文鏈接

方法一:

血凝塊于室溫下自然解凍后,取約1.0cm3的血凝塊樣本,加入適量生理鹽水,浸泡15min6000r/min離心5min,棄上清。沉淀機械磨碎(勿過度),加入適量提取液(10mmol/LTris2HCL100mmol/LNaCl10mmol/LEDTA2%SDS)浸泡30min6000r/min離心5min,棄上清。沉淀中加消化液500μl(10mmol/LTris1mmol/LEDTA20g/LSDS300Lg/ml蛋白酶K)552h,其中每隔0.5h顛倒混勻一次,然后于37過夜。加等體積飽和酚,充分混勻,10000r/min離心5min;吸取上層水相,加等體積飽和酚:氯仿:異戊醇(25241);充分混勻,10000r/min離心5min;取上清加氯仿:異戊醇500μ1(241)10000r/min離心5min;取上清加1/10體積的NaAc(3mol/L),混勻,再沿管壁緩慢加入2倍體積的預(yù)冷無水乙醇,10000r/min離心5min,棄上清;用預(yù)冷75%乙醇洗滌,離心,棄上清,盡量將酒精吸干凈,自然晾干(或真空抽干)50μl TE溶解(10mmol/LTris1mmol/LEDTA)。如有不溶物,用蛋白酶K處理后再溶解。-20保存

 

方法二:

35 ml 血塊+ 5 ml 溶血試劑→入10 ml 勻漿管勻漿并用25 ml 溶血試劑洗至50 ml 離心管4 3000 r/ min 10 min →棄上清沉淀加20 ml 溶血試劑4 4 000 r/ min 10 min →棄上清沉淀加1. 5 ml 0. 5 % SDS 的核懸液輕洗至5 ml 離心管20 g/ ml的蛋白酶K10μl 37 水浴過夜→加等體積平衡酚混勻4 3 500 r/ min 10 min →小心吸去上層酚溶劑加等體積氯仿∶異戊醇(241)混勻4 3 500r/ min 10 min →輕輕吸取上清液至2 ml 離心管1/ 10 體積(0. 1 ml) 3 mol/ L NaAc 和等體積異丙醇輕輕顛倒幾次可見有白色絮狀物析出→8 000r/ min 2 min 棄上清分別加75 %和無水乙醇洗2次→棄乙醇液置真空干燥器內(nèi)24 h 100μl TE緩沖液溶解DNA - 20 保存。

 

方法三:

1、解凍樣品  -80冰箱中取出血樣,在4冰箱中解凍,若其后仍有血凝塊,加入適量生理鹽水,浸泡15min,以3000r/min離心5min,棄上清液,取沉淀物

2、裂解紅細胞  將樣品置于15mL離心管內(nèi),窩旋混勻至血細胞懸起,加入10mL紅細胞裂解液,上下顛倒離心管,4環(huán)境放置20min,其間上下顛倒3次,使紅細胞完全裂解.在室溫條件下,以2000r/min離心10min.棄掉上清液,取白色沉淀.用生理鹽水洗滌沉淀,2000r/min離心5min,棄上清液.若洗滌后沉淀不是白色,可重復(fù)上述步驟,直到沉淀呈白色為止,紅細胞裂解液可加至10.

裂解白細胞  用生理鹽水洗滌白色沉淀,收集白細胞,窩旋混勻至白細胞懸起,加入3mL白細胞裂解液,吹打數(shù)次使沉淀分散,在37水浴中孵化(期間可吹打2次)1h,如孵化后仍有細胞團,可再加入1mL白細胞裂解液重復(fù)以上操作,直至溶液透明為止.

消化蛋白質(zhì)  向每3mL樣品中加入15μL蛋白酶K,上下顛倒25次,37孵化15min4條件下冷卻,加入1mL飽和氯化鈉溶液,窩旋混勻1020s(可見蛋白凝塊),4冰箱中放置10min,在室溫條件下以2000r/min離心10min,應(yīng)于管底部出現(xiàn)沉淀,若沒有或量少,可靜置35min,再行離心.

5  DNA的抽提  將上清液移至內(nèi)有3mL異丙醇的試管中,上下緩慢顛倒試管至DNA絲壯物形成,在室溫條件下,以2000r/min離心2min,可見白色DNA沉淀.將上清液棄掉,加入700mL/L乙醇溶液3mL,上下顛倒數(shù)次,洗滌DNA沉淀及管壁,在室溫條件下以2000r/min離心2min,可見白色DNA沉淀.棄掉上清液,加入1mL乙醇,混合均勻,置于離心管內(nèi),在4條件下以13000r/min離心5min,小心移去上清液,將離心管倒立在濾紙上,干燥至DNA團塊呈半透明狀為止.加入TE buffer 250μL65孵化1h,定時彈擊試管壁使溶液混合均勻,在4條件下過夜,使DNA水合,分裝于5個冷凍管內(nèi),于-20保存.

 

方法四:

堿性裂解法

取血凝塊標本于室溫條件下自然溶解,勻漿(可加適量生理鹽水,也可不加),取0.5ml勻漿液(不同劑量標本其相應(yīng)試劑用量按比例計算即可)于1.5ml Eppendorf管中;加入500μl 50mmol/l NaOH溶液,充分混勻后于60保溫10min;然后加入50μl 1mol/L Tris-HCl溶液(pH8.0),充分混勻后4 12000r/min 離心10min;小心取上清與另一Eppendorf’管,加兩倍體積預(yù)冷的無水乙醇,充分混勻后于4 12000r/min 離心10min;棄上清,在室溫條件下干燥15min后加入100μl 1×TE buffer 充分溶解;最后將DNA溶液放置于-20冰箱備用,保存3個月以上則應(yīng)放入-70冰箱。


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