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植物RNA提取方法

作者:新景實驗室
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異硫氰酸胍法 

1 g葉片液氮下充分研磨迅速轉移至離心管加入3 mL 異硫氰酸胍提取液(4M異硫氰酸胍、2.5 M檸檬酸鈉pH7.00.5 %十二烷基肌氨酸鈉0.1 M巰基乙醇) 混勻。再依次加入0.3 mL 2 M NaAc (pH 4.0)3 mL水飽和酚和0.6 mL 氯仿/ 異戊醇(491) 混勻后冰浴15 min4 12 000 r/ min 離心20 min。上清液加入等體積苯酚/ 氯仿再次抽提離心上清液加入等體積異丙醇-20 沉淀RNA4 12000r/ min 離心10 min75 %乙醇洗滌兩次100 %乙醇脫水。溶于100μl DEPC 重蒸水中。

 

尿素法 

1 g葉片加入過量液氮充分研磨快速轉入離心管加入68倍體積的裂解緩沖液(7 M 尿素50 mM Tris-Cl pH8.010 mM Na2EDTA pH 8.03.5 M NaCl 6.25 %Tris 飽和酚pH 8.0 0.1 % SDS + 0.1 % LDS) 輕輕攪拌后0 冰浴20 min4 12000 r/ min離心15 min。上清液加1/ 3 體積3 M NaAc (pH5.3) 1/ 5 體積的氯仿/ 異戊醇(241)混勻后0 冰浴20 min4 12000 r/ min 離心15 min。上清液加入等體積冰浴冷卻的異丙醇冰浴10 min4 5000 r/min 離心10 min。沉淀溶于5 mL 含有0.1 % SDS TE 緩沖液中加入8M LiCl 至終濃度2.5 M冰浴3 h 4 12000 r/min 離心10min75 %乙醇洗滌沉淀兩次空氣干燥后溶于DEPC 處理水中。

 

Tris - 硼酸法

離心管中加15 mL 提取緩沖(150 mMTris 50 mM EDTA 4 % SDS 硼酸調pH 7.5) 10μl 巰基乙醇加熱到65 1 g葉片充分研磨后轉移到離心管中混勻 65 1min。室溫放置5 min。加1.5 mL 5 MKAc 4 mL乙醇渦旋。20 mL 氯仿/ 異戊醇( 241) 混勻后8000 r/min 離心20 min。上清液加入10 mL 苯酚和10 mL 氯仿/ 異戊醇10000 r/min 10 min。上清液中加入0.3 倍體積12 M LiCl 混勻 - 20 過夜。10000 r/min 1 min。沉淀溶于10 mL 3 MLi2Cl 10000 r/ min 10 min。沉淀溶于470μl DEPC 重蒸水30μl 5M KAc 等體積氯仿/ 異戊醇抽提10000 r/ min 5 min。上清液轉入兩倍體積的乙醇中- 20 沉淀RNA4 10 000r/ min 離心20 min。沉淀干燥后溶于100 μl DEPC 重蒸水中。

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