異硫氰酸胍法
取1 g葉片,液氮下充分研磨,迅速轉移至離心管,加入3 mL 異硫氰酸胍提取液(4M異硫氰酸胍、2.5 M檸檬酸鈉,pH7.0,0.5 %十二烷基肌氨酸鈉,0.1 M巰基乙醇) 混勻。再依次加入0.3 mL 2 M NaAc (pH 4.0),3 mL水飽和酚和0.6 mL 氯仿/ 異戊醇(49∶1) ,混勻后冰浴15 min。4 ℃,12 000 r/ min 離心20 min。上清液加入等體積苯酚/ 氯仿再次抽提,離心,上清液加入等體積異丙醇,-20 ℃沉淀RNA。4 ℃,12000r/ min 離心10 min。75 %乙醇洗滌兩次,100 %乙醇脫水。溶于100μl DEPC 重蒸水中。
尿素法
取1 g葉片,加入過量液氮充分研磨,快速轉入離心管,加入6~8倍體積的裂解緩沖液(7 M 尿素,50 mM Tris-Cl ,pH8.0,10 mM Na2EDTA ,pH 8.0,3.5 M NaCl ,6.25 %Tris 飽和酚,pH 8.0 ,0.1 % SDS + 0.1 % LDS) ,輕輕攪拌后,0 ℃冰浴20 min。4 ℃,12000 r/ min離心15 min。上清液加1/ 3 體積3 M NaAc (pH5.3) ,1/ 5 體積的氯仿/ 異戊醇(24∶1),混勻后0 ℃冰浴20 min。4 ℃,12000 r/ min 離心15 min。上清液加入等體積冰浴冷卻的異丙醇,冰浴10 min。4 ℃,5000 r/min 離心10 min。沉淀溶于5 mL 含有0.1 % SDS 的TE 緩沖液中,加入8M LiCl 至終濃度2.5 M,冰浴3 h 。4 ℃,12000 r/min 離心10min。75 %乙醇洗滌沉淀兩次,空氣干燥后溶于DEPC 處理水中。
Tris - 硼酸法
離心管中加15 mL 提取緩沖(150 mMTris ,50 mM EDTA ,4 % SDS ,硼酸調pH 至7.5) 和10μl 巰基乙醇,加熱到65 ℃。1 g葉片充分研磨后轉移到離心管中混勻, 65 ℃, 1min。室溫放置5 min。加1.5 mL 5 MKAc ,4 mL乙醇,渦旋。20 mL 氯仿/ 異戊醇( 24∶1) 混勻后,8000 r/min 離心20 min。上清液加入10 mL 苯酚和10 mL 氯仿/ 異戊醇,10000 r/min ,10 min。上清液中加入0.3 倍體積12 M LiCl 混勻, - 20 ℃過夜。10000 r/min ,1 min。沉淀溶于10 mL 3 MLi2Cl 中,10000 r/ min ,10 min。沉淀溶于470μl DEPC 重蒸水,加30μl 5M KAc ,等體積氯仿/ 異戊醇抽提,10000 r/ min ,5 min。上清液轉入兩倍體積的乙醇中- 20 ℃沉淀RNA。4 ℃,10 000r/ min 離心20 min。沉淀干燥后溶于100 μl DEPC 重蒸水中。