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可能的原因：
1、制作的凝膠從加樣孔至DNA泳動方向呈現為一個降低的斜面，DNA在泳動的過程中大量地流失到電泳緩沖液中。制作瓊脂糖凝膠時應注意放平制膠槽，并加入足夠量的凝膠液。
2、凝膠沒有完全被溶解，DNA仍保留在未溶解的凝膠中。在50°C溶膠時每隔2-3分鐘請將離心管漩渦振蕩數秒以幫助凝膠徹底溶解。
3、在凝膠溶解后的溶液中加入異丙醇出現霧狀沉淀。出現該種現象主要是因為凝膠沒有被徹底溶解，此時應注意不要省略后續的Bufffer G的洗滌步驟，并且加入BufferG到純化柱中后室溫靜置1分鐘，以增強對未溶解的凝膠的洗滌效果。