實驗室的小伙伴們都知道,提取DNA的血液樣本需要放在﹣20℃冷凍保存,如果是為了提取RNA還必須放在﹣80℃保存才行。萬一不小心將血液樣本遺忘在4℃冰箱幾個星期的話,血液中的RNA估計已經(jīng)完全沒救了,那DNA的情況又是怎么樣的呢?正好實驗室這有一管血液不小心放在4℃兩個月了,讓我們一起來測試一下吧!
一.實驗?zāi)康模?/span>
測試提取4℃下放置2個月的抗凝全血中的DNA。
二.實驗材料:
4℃放置2個月的抗凝全血
全血DNA小量試劑盒(SIMGEN Cat.No.3001050)
全血/培養(yǎng)細(xì)胞DNA試劑盒(SIMGEN Cat.No.3002050)
2×PCR Mix(Simgen,Cat.No.7003100)、Human β-globin gene引物(Forward:TTAGGCCTTAGCGGGCTTAGAC;Reverse:CCAGGATTTTTGATGGGACACG)。
旋渦震蕩器(越新儀器,XH-C)
電子恒溫不銹鋼水浴鍋(上海宜昌儀器紗篩廠)
臺式離心機(eppendorf Centrifuge 5415 D)
超微量分光光度計(SIMGEN Cat.No.sim100)
電泳儀(北京六一儀器廠,DYY-6C型 )
PCR儀(Techne FPROGO5Y Progene Thermal)
三.實驗內(nèi)容:
四.實驗結(jié)果:
1. 在超微量分光光度計上用各自試劑盒中的BufferTE調(diào)零,測量提取好的DNA,結(jié)果如下:
樣品編號1、2為全血DNA小量試劑盒提取的DNA;樣品編號3、4為全血/培養(yǎng)細(xì)胞DNA試劑盒提取的DNA
2. 在1%的瓊脂糖凝膠上,加入5 μl提取到的DNA,電泳25 min,結(jié)果如下:
3. 在1%的瓊脂糖凝膠上,加入5 μl擴(kuò)增產(chǎn)物,電泳20 min,結(jié)果如下:
五.實驗討論與分析:
1. 從超微量分光光度計濃度測量結(jié)果上可以看出,兩個試劑盒均提取到了一定數(shù)量的DNA,結(jié)合圖一結(jié)果可以進(jìn)一步證實4℃下放置2個月的抗凝全血中的DNA并沒有完全降解,只是拖尾嚴(yán)重,但還保留有明顯的主帶。
2. 從圖二的電泳結(jié)果分析可以得出結(jié)論:4℃放置2個月的抗凝全血中提取的DNA并不影響PCR擴(kuò)增。
3. 仔細(xì)觀察圖一中血液基因組DNA的電泳條帶,會發(fā)現(xiàn)DNA的拖尾實際上是類似DNA Marker的條帶,這是典型的凋亡細(xì)胞特征條帶。其真正的原因是白細(xì)胞(紅細(xì)胞無核,提取不到DNA)由于得不到機體提供的養(yǎng)分,已經(jīng)開始死亡,自溶。這也說明4℃條件下,血液中的DNA會緩慢地降解,確實不適合用作長期保存血液。
4. 最后我們可以告訴大家一個好消息,就是萬一不小心將血液遺忘在了4℃冰箱中,短期內(nèi)(至少2個月內(nèi))提取DNA影響不大(主要影響就是提取到的DNA拖尾嚴(yán)重),提取到的DNA用作模板也不影響目的片段不是很長的PCR擴(kuò)增。