實驗目的:
從種子中提取DNA。
實驗材料:黃豆、面粉、研缽、植物DNA試劑盒(Simgen,Cat.No.3201050)
實驗方法:
本次實驗采用Simgen的植物DNA試劑盒方法來提取種子中的DNA,步驟如下:
1. a.黃豆:
稱取黃豆1顆(約200mg),放入研缽中研磨至粉末狀,加入1.5 ml 65℃預熱的Buffer PL,繼續研磨,分別吸取600 μl溶解物加入2個1.5 ml 離心管(相當于每次從約100mg 黃豆中提取DNA);
b.面粉(小麥粉):
2個1.5 ml 離心管中分別稱取100mg和200mg面粉,加入500ml 65℃預熱的Buffer PL,旋渦震蕩至充分溶解;
2. 65℃水浴10分鐘,水浴期間每隔2~3分鐘翻轉離心管數次以幫助DNA的釋放;
3. 加入350 μl Buffer K,蓋上管蓋,用力搖晃15秒,旋渦振蕩30秒。13000 rpm離心5分鐘;
4.將離心上清液倒入核酸純化柱中,離心去濾液;
5. 依次用500 μl Buffer WA和600 μl Buffer WB過柱洗滌;
6. 最高速離心,去除純化柱上殘留的乙醇;
7. 將核酸純化柱置于一個潔凈的1.5ml離心管中,用60 μl 65℃預熱的Buffer TE 洗脫DNA;
8. 在微量紫外分光光度計上測量DNA的濃度;
9. 瓊脂糖凝膠電泳。
實驗結果:
1. 在微量紫外分光光度計上用Buffer TE調零,測量洗脫下來的DNA,結果如下:
2. 在0.6%的瓊脂糖凝膠上,加入8μl提取到的DNA,電泳30 分鐘,結果如下:
討論與分析:
1.用Simgen植物DNA試劑盒能提取到黃豆、面粉(小麥粉)的DNA,說明在干燥的種子中,DNA保存得比較完整。
2.面粉DNA的電泳條帶顯示有明顯的拖尾現象,產生了類似凋亡細胞的DNA帶型。推測是由于種子被磨碎后,DNA更容易失去組蛋白的保護,從而形成凋亡細胞的DNA帶型。
3.由于植物種子中DNA含量較低,可適度提高樣本的用量(以面粉DNA提取為例),但樣本用量不應大于200mg。以200 mg面粉提取DNA為例,樣本加入裂解液(Buffer PL)水浴后變得非常粘稠,操作變得困難,且DNA回收量與100mg相比也沒有成倍地增長。
4.植物種子通常會含有大量的蛋白、油脂、多糖(淀粉為主),Simgen植物DNA試劑盒在提取過程中能很好地抵御這些干擾。
Simgen實驗室